故事承接第一部结尾，自从森林王子莫格利（海利·乔·奥斯蒙 Haley Joel Osment配音）认识了人类女孩珊迪（梅·惠特曼 Mae Whitman配音），便随她一同居住在人类村庄中。然而离开丛林生活的莫格利，却在新的环境里异常想念他的动物朋友们…

本片是叙述11岁犹太裔的罗米克（海利乔奥斯蒙饰），为了躲避纳粹的迫害，被父执辈的友人收容并躲在乡下，与他的孩子们一起生活，期间认识了一些朋友，一起上教堂，听神父讲道。但其中让罗米克不解的是这些孩童常常在深夜去火车站，不知为…